按照慣例,在過去的15年里,法國薩能山羊的兩個不受歡迎的毛色被記錄保存。1/5的薩能母山羊一直表現“粉色”(8.0%)或“粉紅脖子”(11.5%)的性狀,因此未被作為候選動物列入育種項目。“粉色”和“粉紅脖子”表型的二進制遺傳力,從103443頭母山羊中估計得“粉色”為0.26,“粉紅脖子”為0.21。全基因組關聯研究(使用單體型或單一SNPs)采用810頭薩能母山羊進行,薩能母山羊由通過山羊SNP50芯片分型的九頭公山羊人工授精得到。
研究發現11號染色體上一個與“粉紅脖子”表型相關的高顯著信號(-log10p值= 10.2),這表明了一個重要基因的存在。在5號和13號染色體上發現了“粉色”表型的高顯著信號(-log10p 值分別為7.2 和7.7)。13號染色體上最顯著的SNP在ASIP基因區域,以其與毛色表型相關而為人所知。
同時,在兩個性狀中都發現了九個顯著的信號。通過單SNP和單體型方法檢測每個特征最顯著的信號,然而較小的信號并為被這兩種方法檢測到??傊?,這些結果表明,法國薩能山羊“粉色”和“粉紅脖子”表型具有較強的遺傳控制因素,表明在育種過程中,SNP信息可以被用來識別并避免選育毛色不受歡迎的動物。